• مكتب مدير عام المركز ، ويختص بالآتي:-
- تنظيم مواعيد مدير عام المركز.
- استلام البريد الوارد وتجهيزه لعرضه على مدير عام المركز وتوزيعه على الجهات المختصة داخل المركز وخارجه لاتخاذ ما يلزم من اجراءات بشأنه.
- حفظ القرارات والمراسلات والمستندات وترتيبها.
- ما يكلف به من أعمال.
• مكتب الشؤون القانونية ، ويختص بالآتي:-
- إعداد قرارات مدير عام المركز.
- إبداء الرأي القانوني في المسائل التي تحال اليه من مدير عام المركز.
- متابعة القضايا التي ترفع من او على المركز بالتنسيق في ذلك مع الإدارة العامة لمتابعة للتشريعات والشؤون القانونية والإدارات المختصة بالمركز.
• مكتب المراجعة الداخلية ، ويختص بالآتي:-
- التحقق من مراعاة جميع احكام قانون النظام المالي للدولة وتعديلاته ولائحته التنفيذية.
- مراجعة المستندات المالية والفواتير قبل الصرف والتأكد من أن الصرف تم وفقا للتشريعات النافذة.
- المشاركة في لجان جرد الخزائن والجرد المفاجئ بالتنسيق مع الجهات ذات العلاقة بالمركز.
- مراجعة الحسابات الختامية للمركز.
• مكتب المتابعة وتأكيد الجودة ، ويختص بالآتي:-
- متابعة تنفيذ ما يصدر عن المركز من قرارات وتعليمات.
- متابعة العمل بالفروع والمكاتب بالمناطق وذلك للتأكد من سلامة الإجراءات.
- جمع المعلومات والبيانات الاحصائية والإدارية والمالية والفنية عن الإدارات والفروع والمكاتب بالإدارة العامة والمناطق، وإعداد التقارير ربع السنوية والسنوية عن عمل المركز.
- متابعة سرعة إنجاز الإجراءات الإدارية والفنية اللازمة للإفراج عن السلع الغذائية والدوائية.
- المشاركة في إعداد دليل عمل المختبرات ودليل التحاليل للسلع التي تدخل في اختصاص المركز.
- متابعة مدى تقيد العاملين بالمركز بالتحقق من انطباق المواصفات القياسية المعتمدة عن السلع التي تم منح الأذن بتسويقها.
• مكتب الأعلام والمعلومات الخدمية، ويختص بالآتي:-
- توثيق الشركات والتشاركيات والمصانع المحلية وفقا للإجراءات القانونية المتبعة بالخصوص.
- تقديم المعلومات اللازمة للموردين والمنتجين لانجاز عمليات الاستيراد او التصدير والتصنيع وفقا للتشريعات النافذة.
- متابعة ما ينشر في الصحف ووسائل الإعلام والرد عليها.
- تقديم المواد والمعلومات الإعلامية الى وسائل الإعلام المختلفة المتعلقة بنشاط المركز.
- نشر التوعية والتثقيف الغذائي والدوائي.
- إنشاء وتطوير شبكة للمعلومات العلمية والفنية والإدارية في مجال الرقابة الغذائية والدوائية والعمل على تحديثها.